第155回自然環境論セミナー
「Development of effective models for vectorial biological processes」

開催について

日時	2006年5月30日 (火) 13:20～14:50
会場	神戸大学発達科学部 G112 (G棟1階)
対象	どなたでも参加できます。
参加方法	当日、直接、会場へお越しください。
参加費	無料
主催	神戸大学発達科学部人間環境科学科自然環境論講座
連絡先	メール: tanaka2@【続けて「kobe-u.ac.jp」を入力してください】 (田中成典 (発達科学部自然環境論講座))

プログラムについては <http://neweb.h.kobe-u.ac.jp/seminar/seminar155.html> もご覧ください。

講演タイトル	「Development of effective models for vectorial biological processes」
講師	Qiang Cui (Department of Chemistry and Theoretical Chemistry Institute, University of Wisconsin-Madison)

概要 (Abstract): Progress towards understanding vectorial processes in biological systems using theoretical and computational approaches will be discussed. The specific problems of interest include mechanochemical coupling in the molecular motor myosin, vectorial proton pumping in cytochrome c oxidase and the gating of mechanosensitive channels. Several related methodological developments will be discussed, which include boundary potential for QM/MM simulations, effective QM methods for treating long-range proton transfers and phosphate chemistry, and coarse-grained models for describing large-scale motions in biomolecules. Quantitative benchmark calculations of these methods have been carried out using both model and realistic biological systems. The application of these methods will be briefly discussed.